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新事業進出補助金の公募要領の補助対象外事業には、「補助事業の主たる内容そのものを他者へ外注又は委託する事業、及び具体的な補助事業の実施の大半を他社に外注又は委託し、企画だけを行う事業」とありますので、これに該当すると判断された場合は補助対象外になる可能性があります。

ただ、新規事業の企画・設計を自社で行い、製造を外部に外注する事業は過去採択されている例は多いので、問題は「運営」だと思われます。運営まで外注となると、申請者が主体的に行う事業としてみなされない可能性が高いですので注意しましょう。