こんにちは。
確かにご指摘の通り、無理に新事業を進めることで会社が傷ついてしまうケースもありますので選択肢としてはその後判断はあると思います。

新事業進出補助金の補助事業の手引きの「採択を辞退する際の手続き」には「電子申請システムマイページ上の「採択辞退届出」から、申請してください。提出書類は不要です。」とありますので、交付決定前に採択辞退の手続きを取る必要性があります。