こんにちは。
お答えとしては「第3段階」は、「製品が１つ以上販売されている、又はサービスが１回以上提供されている。」状態を指します。

新事業進出補助金の公募要領「減点項目」の「他の補助事業の事業化が進展していない事業者」に「過去に以下の補助金を受給している場合、当該補助金による補助事業の、直近の事業化状況報告等における事業化段階が３段階以下である場合は、減点を行います。
・新事業進出補助金　・事業再構築補助金　・ものづくり補助金」とあります。
これに該当すると減点の可能性があります。