こんにちは。
新事業進出補助金の補助事業の手引きには、「端数は国税通則法基本通達「第119条関係」の考え方に基づき1円未満を切り捨てて算出してください。」とありますので、費目金額ごとに1円未満を切り捨てて算出すると考えます。