こんにちは。
はい、補助対象経費に関する全ての支払いは、実績審査にて銀行振込の確認を行います。
ですから、現金払い、他の取引との相殺や代引き払い等は認められません。
通帳に残るようにしましょう。
支払いは取り返しがつかないので、特殊な精算ケースであれば必ず、事前に事務局に問い合わせて問題ないか確認しておきましょう。

新事業進出補助金の公募要領には、「現金払い、他の取引との相殺による支払い、代引き払い、手形による支払い（L/C決済を含む）、手形の裏書譲渡、小切手、ファクタリング（債権譲渡）による支払い等は対象外です。PayPayやPayPalなどの決済サービスは銀行振込とみなされません」とありますので一読しましょう。